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科研数据处理——计算IC50

2016-08-21 张浩然 弗雷赛斯

什么是IC50:


IC50 (half maximal inhibitory concentration)又叫半抑制浓度,它能指示某一药物或者物质(抑制剂)在抑制某些生物程序(或者是包含在此程序中的某些物质,比如酶,细胞受体或是微生物)的半量。在凋亡方面,可以理解为一定浓度的某种药物诱导肿瘤细胞凋亡50%,该浓度称为50%抑制浓度,即凋亡细胞与全部细胞数之比等于50%时所对应的浓度,IC50值可以用来衡量药物诱导凋亡的能力,即诱导能力越强,该数值越低,当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。在间接竞争ELISA标准曲线中是一个非常重要的数据,标准曲线是一个S型曲线。

任务:绘制量效曲线,计算IC50:




IC50:半数抑制浓度(对应上图),Y轴的研究指标随浓度递减。

EC50:半数有效浓度(对应下图),Y轴的研究指标随浓度递增。

右图其实是把Cell Inhibition当成药物的效应,与药物浓度呈正相关。

其实对于细胞毒实验,两者是相等的。

如果药物有抑制细胞活性的作用,习惯上称之为IC50(称呼而已)

【实例操作1】细胞毒实验计算IC50:



拓展知识:计算IC50的其他方法:


方法1:前面已演示,用Excel计算Mean,SD和N,转换成百分数后用GraphPad计算。注意选择normalized Response-Variable slope。


方法2:XY→Use sample data→Dose response,直接将吸光度值输入GraphPad近似计算。选择response-Variable slope。【快速,但有近似,有主观成分】


方法3:使用SPSS,分析→回归→Probit。


方法4:使用Excel,对中间呈线性的几个点进行线性拟合,用线性方程来近似计算。【简易,但有近似,有主观成分】

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未完待









浩然专栏
张浩然,男,北京大学药学博士,创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。等不及想看四部曲?给我们发送H002,打包给你哦。





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